《云南大学学报(自然科学版)》是云南省教育厅主管、云南大学主办的自然科学综合性学术刊物，于1938年创刊。在创刊号上，刊载有世界著名数学家陈省身、中国物理学家赵忠尧和我校知名教授、化学家赵雁来等的论文。本刊现为双月刊，国内外公开发行，主要反映云南大学理科各院系、各研究单位的最新科研成果，促进国内外学术交流，主要发表自然科学基础理论研究、应用基础研究以及高新技术方面的学术论文、研究简报、学术动态等。
《云南大学学报（自然科学版）》是云南省最早创刊的自然科学类连续出版物，创刊号(见附图)上刊载有世界著名数学家陈省身、中国物理学家赵忠尧和我校知名教授、化学家赵雁来等的论文。学报创刊号的封二中说：“本学报专载有创获之科学及其它研究论文”。这是办学的宗旨，也是办刊的宗旨。
主要栏目：数学、计算机科学、电子与信息科学、、物理学、地球科学、材料科学、化学、生物学（生态学）。
历史沿革
云南大学创办于1923年。《云南大学学报（自然科学版）》的历史同样悠久，是云南省创办最早，现仍在继续出版的学术刊物。
创办之初的云南大学名为“私立东陆大学”。1923年秋出版了《东陆校刊》。
1930年改“私立东陆大学”为“云南省立东陆大学”。1932年出版了《云南省立东陆大学校刊第六届毕业纪念号》。其中，自然科学论丛是5个栏目之一，有5篇论文。
1934年，改“云南省立东陆大学”为“云南省立云南大学”。1937年，云南大学编辑委员会出版了《云大特刊》。内容分为3个部分：论著、小品、附录。论著部分有17篇论文，有医学1篇，数学1篇，还有云南气象、个旧锡矿、个碧石铁路等问题的论著。
1938年7月1日，改“云南省立云南大学”为“国立云南大学”，同年8月出版了《云南大学学报》第二类第一号，为外文版。发表了世界著名数学大师陈省身、中国物理学家赵忠尧、云南大学知名教授赵雁来等的学术论文。这期刊物的名称与现在我校学报的名称相同，因此，将其视为创刊号。
1956年第1期《云南大学学报》印数为1360份，出版许可证为云南省期刊登记证出期数字第叁号，由新华书店云南分店发行。
1957年，出版了《云南大学学报（自然科学版）》共4期，其中第4期为“云南丽江玉龙山植被调查专号”，由云南省邮电管理局发行。
1960年，出版学报1期，为“云南自然保护区植被专号”，刊登了西双版纳大勐笼、勐仑、勐腊和景东无量山自然保护区植被调查的学术论文。
至1978年，在长达40年的办刊历程中，学报时断时续，共出版了13期，刊名曾用过《云南大学学术论文专集》、《云南大学科技文集》、《云南大学自然科学文集》等。
1979年开始恢复《云南大学学报（自然科学版）》这一刊名，为不定期内部发行；1984年定为季刊，经管理部门批准限国内发行；1986年3月由中共云南省委宣传部批准国内外公开发行，批准文号“宣字（1986）3号”，并获得国际连续出版物编号“ISSN0258—7971”。1997年改为双月刊。2000年变更刊号为CN53—1045/N，批准文号“新出报刊（99）第1372号文”。
自创刊至2018年12月31日，学报共出版40卷，260余期（含增刊）。
学报历任主编：
杨桂宫（1979—1987）；姜汉侨（1988—1995）；杨思忠（1996）；朱维华（1997）；洪品杰(1998—2001）；张克勤(2002—2015）；张力(2016— ）